肉眼ではほとんど観察することができない微生物は、一般の人々にはほとんど無視されている、常に存在する生命体である。その複雑な生物学、どこにでもいる存在、生態系における基礎的な性質から、微生物はBioClubのコミュニティメンバーが研究すべき魅力的なトピックとなる可能性を秘めています。ミクロコスモスと題されたこのプロジェクトでは、環境から既知の生息地（コケ、様々な水源など）をサンプリングし、顕微鏡を使って目視で同定することで、こうした目に見えない微生物への関心を高めることを目指す。これまでのところ、コケからタテジマムシ、線虫、繊毛虫など、未同定の微生物を含む鮮明な写真やビデオ映像が得られることを実証している。さらに、これらの実験から得られたデータは、研究、科学コミュニケーション、その他のプロジェクトに利用できる可能性がある。渋谷の小宇宙のローカルマップとデータベースを作成することも一つの目標である。